تعمل المنظمة الدولية للهجرة على حماية وتعزيز حقوق جميع الأشخاص المتنقلين، بما في ذلك المهاجرين والمجتمعات والأفراد المتضررين من الصراع والنزوح. وتهدف المنظمة إلى تعزيز الوصول إلى خدمات الحماية، والسعي وراء سبل الانتصاف، ودعم المجتمعات المتضررة في حماية ذاتها. 

وإدراكاً منها بأن الوصول إلى خدمات الحماية لا يزال محدوداً للغاية في اليمن، تسعى المنظمة الدولية للهجرة إلى تعزيز تقديم الخدمات، وتقوية مسارات الإحالة، وتحديد طرق مبتكرة وآمنة لدعم الهياكل المجتمعية والعمل معها. 

وتتبنى المنظمة منهجية شاملة لإدراج أنشطة الحماية في مختلف البرامج متعددة القطاعات، مع تدريب الموظفين على التحديد الآمن لقضايا الحماية وإحالتها. 

وتساعد المنظمة الدولية للهجرة المهاجرين الذين تقطعت بهم السبل في العودة الآمنة والطوعية والكريمة من اليمن إلى بلدانهم الأصلية إذا رغبوا في ذلك، من خلال برنامج العودة الإنسانية الطوعية. كما تساعد المنظمة اللاجئين الذين يرغبون في العودة إلى ديارهم من خلال برنامج العودة التلقائية المشمولة بالمساعدة، بالتنسيق مع المفوضية السامية للأمم المتحدة لشؤون اللاجئين. 

في عام 2022م، وصلت المنظمة الدولية للهجرة إلى أكثر من 76,000 مهاجر وغيرهم من الفئات السكانية الضعيفة من خلال المساعدات الطارئة، والرعاية الصحية، وإدارة حالات الحماية المخصصة، ودعم الإحالة، والعودة الإنسانية الطوعية.